Au fin fond de la galaxie, le Léviathan, un immense vaisseau spatial, flotte à la dérive. Des pilleurs d’épaves s’y introduisent et découvrent le journal intime de Kazuma, un collégien qui raconte les événements dramatiques qui s’y sont déroulés des années plus tôt. Ils sont en outre convaincus qu’un survivant de la catastrophe se cache encore à bord.